Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms