Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp48Q3V0C5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms