Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms