Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Skap2Q3UND0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms