Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Nkx6-3Q3UHX8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Nkx6-3Q3UHX8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms