Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U595 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U595 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U595 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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