Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
LcorlQ3U285 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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LcorlQ3U285 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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LcorlQ3U285 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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LcorlQ3U285 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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LcorlQ3U285 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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LcorlQ3U285 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LcorlQ3U285 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms