Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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