Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms