Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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RubcnlQ3TD16 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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RubcnlQ3TD16 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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RubcnlQ3TD16 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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RubcnlQ3TD16 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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RubcnlQ3TD16 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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RubcnlQ3TD16 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RubcnlQ3TD16 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RubcnlQ3TD16 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RubcnlQ3TD16 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RubcnlQ3TD16 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RubcnlQ3TD16 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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RubcnlQ3TD16 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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RubcnlQ3TD16 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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RubcnlQ3TD16 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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