Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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