Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms