Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms