Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Ttc21bQ0HA38 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc21bQ0HA38 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms