Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms