Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms