Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23aQ01405 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms