Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms