Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pde1bQ01065 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pde1bQ01065 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms