Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H3f3aP84244 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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