Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tra2bP62996 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms