Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms