Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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