Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad23bP54728 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms