Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgd1P52734 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms