Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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TspoP50637 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TspoP50637 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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