Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ThpoP40226 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ThpoP40226 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ThpoP40226 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ThpoP40226 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ThpoP40226 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms