Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ptpn11P35235 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ptpn11P35235 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ptpn11P35235 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ptpn11P35235 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ptpn11P35235 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ptpn11P35235 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ptpn11P35235 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ptpn11P35235 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ptpn11P35235 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ptpn11P35235 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ptpn11P35235 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ptpn11P35235 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ptpn11P35235 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn11P35235 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ptpn11P35235 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms