Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nedd1P33215 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms