Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms