Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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PdgfraP26618 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PdgfraP26618 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PdgfraP26618 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PdgfraP26618 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PdgfraP26618 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PdgfraP26618 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PdgfraP26618 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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