Protein–RNA interactions for Protein: P24288

Bcat1, Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcat1P24288 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Bcat1P24288 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms