Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gata1P17679 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gata1P17679 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gata1P17679 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gata1P17679 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms