Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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