Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms