Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
P01747 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
P01747 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
P01747 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P01747 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P01747 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms