Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01649 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01649 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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P01649 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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P01649 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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P01649 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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P01649 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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P01649 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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P01649 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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P01649 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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P01649 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01649 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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