Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops6O88545 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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