Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp4O70480 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms