Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E2f6O54917 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms