Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DffaO54786 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DffaO54786 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
DffaO54786 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
DffaO54786 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DffaO54786 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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