Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Eftud2O08810 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms