Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r80L7N1Z3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms