Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms