Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Zfp870J3QMA4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp870J3QMA4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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