Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms