Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms