Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm3020E9Q3J7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm3020E9Q3J7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm3020E9Q3J7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm3020E9Q3J7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm3020E9Q3J7 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm3020E9Q3J7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm3020E9Q3J7 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm3020E9Q3J7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm3020E9Q3J7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm3020E9Q3J7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm3020E9Q3J7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms