Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Polq-201ENSMUST00000054034 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sfta2E9PXB6 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms