Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4931429L15RikE9PVU2 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms